雙區自動空調，也稱為雙溫區自動空調，指的是擁有兩個溫區，即前排空間左右兩側的溫區可各自獨立進行溫度調節的空調系統。
雙區自動恒溫空調的主要功能是當車內溫度接近司乘人員所設定的人體舒適溫度時，壓縮機自動停止轉動，保持溫度的恒定，而當溫度上升時壓縮機會自動工作。
其特點包括：

1. 風力調節更細膩，低檔風時可有如輕風蕩漾，而手動空調通常最多只有 4 級風；
2. 溫度設置規范一般為 17 度至 35 度；
3. 操作者只需設置溫度，系統會根據設置來控制風力、冷熱、風門角度等，綜合完成恒溫控制；
4. 具備自動 / 手動雙重控制模式；
5. 可控制內外循環風，定時調節室內空氣，保持空氣清新；
6. 能夠控制風向，如吹臉、吹腳、吹前擋玻璃等。

使用雙區自動空調時，駕駛人與副駕駛座雙區域的溫度和風量可以獨立調節，從而可以控制在自己覺得最舒適的空調溫度，使舒適性得到很好的改善。有些車輛上會有 “dual” 或 “sync” 等按鍵，用于控制分區功能。按下該按鍵后，副駕駛的溫度顯示會與主駕駛同步，或者取消副駕駛的獨立控制權利，讓空調都由主駕駛控制。另外，自動空調在燃油經濟性方面也有一定優勢。